{"id":3549,"date":"2020-04-09T20:36:52","date_gmt":"2020-04-09T20:36:52","guid":{"rendered":"https:\/\/mribeirodantas.xyz\/blog\/?p=3549"},"modified":"2020-04-12T05:31:10","modified_gmt":"2020-04-12T05:31:10","slug":"como-gerar-um-grafico-de-barras-animado-do-covid19-em-sp","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/mribeirodantas.xyz\/blog\/index.php\/pt\/2020\/04\/09\/como-gerar-um-grafico-de-barras-animado-do-covid19-em-sp\/","title":{"rendered":"Como gerar um gr\u00e1fico de barras animado do COVID19 em SP?"},"content":{"rendered":"<span class=\"span-reading-time rt-reading-time\" style=\"display: block;\"><span class=\"rt-label rt-prefix\"><b>Reading time: <\/span> <span class=\"rt-time\"> 3<\/span> <span class=\"rt-label rt-postfix\">minutes<\/b><\/span><\/span>\n<p>Ap\u00f3s ver um gr\u00e1fico de barras animado comparando o n\u00famero de \u00f3bitos di\u00e1rios de COVID19 com outras doen\u00e7as em Nova Iorque <a href=\"https:\/\/twitter.com\/SaudenoBR\/status\/1246878918923227137\">postado pelo Chiavegatto<\/a> no Twitter, fui tomado pela curiosidade de reproduzir o experimento no Brasil, em S\u00e3o Paulo (o estado). Claramente a situa\u00e7\u00e3o l\u00e1 est\u00e1 muito mais complicada, mas ainda assim quis saber como seria a mesma ideia sendo aplicada a S\u00e3o Paulo. Busquei os n\u00fameros de \u00f3bitos para as mais diversas causas em S\u00e3o Paulo, os n\u00fameros de \u00f3bitos de COVID19 de l\u00e1, arregacei as mangas e <a href=\"https:\/\/twitter.com\/mribeirodantas\/status\/1248106718493650944\">compartilhei com amigos e nas minhas redes sociais<\/a> o produto dessa curiosidade, como voc\u00ea pode ver abaixo.<\/p>\n\n\n\n<figure><iframe loading=\"lazy\" src=\"https:\/\/giphy.com\/embed\/chJnCM77ggdzURidy8\" width=\"480\" height=\"373\" allowfullscreen=\"\"><\/iframe><\/figure>\n\n\n\n<!--more-->\n\n\n\n<p>Se voc\u00ea acompanha esse blog, sabe que meus posts tem muito mais intuito de ensinar o que eu fa\u00e7o do que qualquer outra coisa. J\u00e1 tinha em mente escrever esse post para permitir que as pessoas pudessem reproduzir o mesmo gr\u00e1fico animado em outras localidades, ou at\u00e9 atualizarem para S\u00e3o Paulo em um outro momento. No entanto, com v\u00e1rias pessoas pedindo (e aproveitando para dar uma organizada no c\u00f3digo \ud83d\ude33 ) decidi acelerar e j\u00e1 publicar esse post hoje. Como est\u00e1 muito corrido para mim, deixarei para me aprofundar em detalhes em um outro momento, mas j\u00e1 irei compartilhar o c\u00f3digo com voc\u00ea e basicamente o que foi feito, caso n\u00e3o tenha ficado claro para algu\u00e9m. Existem v\u00e1rios coment\u00e1rios nos arquivos de c\u00f3digo-fonte do reposit\u00f3rio no GitHub, mas para quem n\u00e3o tem interesse em c\u00f3digo, mas na metodologia, vamos direto ao ponto.<\/p>\n\n\n\n<h4 class=\"wp-block-heading\">De onde s\u00e3o os dados?<\/h4>\n\n\n\n<p>Os dados de mortalidade s\u00e3o do SIM, <a href=\"http:\/\/tabnet.datasus.gov.br\/cgi\/deftohtm.exe?sim\/cnv\/obt10SP.def\">Sistema de Informa\u00e7\u00e3o sobre Mortalidade<\/a> do Minist\u00e9rio da Sa\u00fade. Os dados utilizados nesse exerc\u00edcio s\u00e3o referentes ao ano de 2018, o mais recente que encontrei. Os dados de COVID19 s\u00e3o do <a href=\"http:\/\/covid.saude.gov.br\">dashboard oficial de COVID19 do Minist\u00e9rio da Sa\u00fade<\/a>.<\/p>\n\n\n\n<h4 class=\"wp-block-heading\">Como a m\u00e9dia di\u00e1ria foi calculada?<\/h4>\n\n\n\n<p>Como os \u00f3bitos de COVID19 em S\u00e3o Paulo s\u00e3o de Mar\u00e7o e Abril, o per\u00edodo dos \u00f3bitos das demais causas utilizado para calcular a m\u00e9dia di\u00e1ria foi tamb\u00e9m de Mar\u00e7o e Abril. Utilizar Mar\u00e7o e Abril, em vez dos 12 meses, permite corrigir algum efeito sazonal que possa existir. Eu fiz de ambos os modos e a varia\u00e7\u00e3o foi muito pequena com uma redu\u00e7\u00e3o de ~1 caso por dia em doen\u00e7as e aumento de ~1 caso por dia para acidentes.<\/p>\n\n\n\n<h4 class=\"wp-block-heading\">Por que essas causas de morte foram escolhidas?<\/h4>\n\n\n\n<p>As causas de \u00f3bito mostradas nesse GIF n\u00e3o s\u00e3o as primeiras N causas de morte. Eu conversei com algumas pessoas e busquei quais eram as maiores causas de morte na opini\u00e3o delas. N\u00e3o quis colocar apenas as que mais matam, mas tamb\u00e9m algumas que \u00e1s vezes nem matam tanto, mas as pessoas acham que s\u00e3o causas de \u00f3bito muito frequentes. <strong>Ainda assim, o COVID19 no dia 7 matou mais do que a m\u00e9dia di\u00e1ria de qualquer outra causa de morte isolada no estado de S\u00e3o Paulo<\/strong>, para a m\u00e9dia di\u00e1ria calculada utilizando Mar\u00e7o e Abril.<\/p>\n\n\n\n<h4 class=\"wp-block-heading\">Onde est\u00e1 o c\u00f3digo-fonte?<\/h4>\n\n\n\n<p>O c\u00f3digo est\u00e1 com v\u00e1rios coment\u00e1rios, foi versionado com Git e est\u00e1 <a href=\"http:\/\/github.com\/mribeirodantas\/covid19gif\">hospedado no GitHub<\/a>. Utilizei o <a href=\"https:\/\/dvc.org\/\">DVC<\/a> para versionar os <em>datasets<\/em> e os pipelines e o <a href=\"http:\/\/github.com\/mribeirodantas\/dsman\">dsman<\/a> para gerenciar o projeto. O GIF gerado l\u00e1 \u00e9 ligeiramente diferente do que compartilhei nas redes sociais e mostrei no in\u00edcio desse post. Aproveitei para brincar com outras causas de morte. O GIF final voc\u00ea pode ver abaixo \ud83d\ude09<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img data-recalc-dims=\"1\" decoding=\"async\" src=\"https:\/\/i0.wp.com\/s6.gifyu.com\/images\/covid19_compar.gif?w=640&#038;ssl=1\" alt=\"\"\/><\/figure>\n\n\n\n<p>Fiz algumas altera\u00e7\u00f5es no layout, melhorei o design em si, o c\u00f3digo, entre outras coisas. Uma coisinha que poderia ficar melhor, por exemplo, \u00e9 adicionar casas decimais no <em>label<\/em> :-). Pela exist\u00eancia da barra, fica evidente que n\u00e3o \u00e9 0 para Influenza (gripe), mas com o label 0 pode acabar confundindo algu\u00e9m. A media di\u00e1ria \u00e9 &lt;0.5. Se algu\u00e9m quiser contribuir para melhorar isso, s\u00f3 mandar um Pull Request l\u00e1 no GitHub com a solu\u00e7\u00e3o \ud83d\ude09<\/p>\n\n\n\n<p>A prop\u00f3sito, o <a href=\"http:\/\/github.com\/mribeirodantas\/dsman\">dsman<\/a> \u00e9 um software fruto de um projeto pessoal que criei h\u00e1 alguns dias. Ele gerencia projetos de <em>Data Science<\/em> no seu computador, armazenando detalhes em um <em>self-contained DBMS<\/em>. Cria estruturas de diret\u00f3rio para projetos de acordo com <em>templates<\/em> em YAML, e inicia o Git, o DVC e hooks automaticamente no in\u00edcio do projeto. Se quiser enviar sugest\u00f5es ou contribuir com c\u00f3digo \/ divulga\u00e7\u00e3o, sinta-se \u00e0 vontade 8).<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p><span class=\"span-reading-time rt-reading-time\" style=\"display: block;\"><span class=\"rt-label rt-prefix\"><b>Reading time: <\/span> <span class=\"rt-time\"> 3<\/span> <span class=\"rt-label rt-postfix\">minutes<\/b><\/span><\/span>Ap\u00f3s ver um gr\u00e1fico de barras animado comparando o n\u00famero de \u00f3bitos di\u00e1rios de COVID19 com outras doen\u00e7as em Nova Iorque postado pelo Chiavegatto no Twitter, fui tomado pela curiosidade de reproduzir o experimento no Brasil, em S\u00e3o Paulo (o estado). 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